Продавец получил от покупателя деньги в качестве обеспечения обязательства по оплате. С этой суммы продавец  должен заплатить НДС. Так считает Минфин – письмо от 16 августа 2016 г. № 03-07-11/47861.

Чиновники рассматривают полученное обеспечение как частичную оплату. Поэтому, полагают, что с него нужно заплатить НДС. Ведь база по налогу возникает либо на дату отгрузки,  либо на день оплаты или частичной оплаты - в зависимости от того, что наступит раньше (подп. 2 п. 1 ст. 167 НК РФ). 

Еще по теме:

- Пояснения в налоговую по НДС (образец)

- Такие УПД по товарам должны быть в бухгалтерии

- Возмещение НДC из бюджета